Protein–RNA interactions for Protein: P05132

Prkaca, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacaP05132 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkacaP05132 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkacaP05132 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkacaP05132 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkacaP05132 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkacaP05132 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkacaP05132 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkacaP05132 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkacaP05132 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkacaP05132 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkacaP05132 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms