Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01798 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01798 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01798 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01798 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01798 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01798 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01798 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P01798 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01798 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
P01798 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01798 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01798 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01798 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P01798 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01798 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01798 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01798 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01798 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01798 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01798 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01798 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01798 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P01798 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01798 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01798 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01798 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01798 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01798 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01798 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01798 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01798 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01798 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01798 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01798 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01798 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01798 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01798 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01798 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01798 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01798 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01798 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P01798 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01798 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01798 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01798 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01798 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01798 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01798 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01798 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01798 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01798 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01798 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01798 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01798 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01798 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01798 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01798 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
P01798 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01798 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01798 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01798 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01798 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01798 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01798 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01798 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01798 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01798 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01798 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01798 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01798 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01798 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01798 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01798 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01798 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01798 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01798 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01798 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01798 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01798 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01798 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01798 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01798 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01798 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01798 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01798 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01798 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01798 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01798 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01798 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01798 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01798 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01798 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01798 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms