Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01630 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01630 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
P01630 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01630 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01630 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01630 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01630 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01630 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01630 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01630 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
P01630 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01630 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01630 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01630 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01630 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01630 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01630 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01630 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
P01630 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,57■■□□□ 1,04
P01630 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P01630 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
P01630 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01630 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01630 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
P01630 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
P01630 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
P01630 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
P01630 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01630 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01630 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01630 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
P01630 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
P01630 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
P01630 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
P01630 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
P01630 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
P01630 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
P01630 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
P01630 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P01630 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P01630 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P01630 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P01630 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
P01630 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
P01630 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
P01630 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
P01630 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
P01630 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
P01630 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,32■■□□□ 1
P01630 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
P01630 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,32■■□□□ 1
P01630 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,31■■□□□ 1
P01630 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
P01630 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
P01630 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
P01630 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
P01630 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
P01630 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
P01630 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
P01630 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
P01630 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
P01630 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
P01630 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
P01630 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
P01630 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
P01630 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
P01630 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,24■□□□□ 0,99
P01630 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
P01630 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
P01630 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,21■□□□□ 0,99
P01630 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
P01630 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,2■□□□□ 0,98
P01630 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
P01630 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
P01630 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
P01630 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
P01630 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
P01630 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
P01630 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
P01630 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
P01630 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
P01630 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
P01630 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
P01630 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
P01630 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,14■□□□□ 0,97
P01630 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
P01630 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
P01630 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
P01630 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
P01630 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
P01630 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
P01630 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
P01630 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
P01630 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
P01630 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
P01630 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
P01630 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,05■□□□□ 0,96
P01630 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
P01630 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,7 ms