Protein–RNA interactions for Protein: O88829

St3gal5, Lactosylceramide alpha-2,3-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St3gal5O88829 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
St3gal5O88829 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
St3gal5O88829 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
St3gal5O88829 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
St3gal5O88829 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
St3gal5O88829 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
St3gal5O88829 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
St3gal5O88829 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
St3gal5O88829 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
St3gal5O88829 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
St3gal5O88829 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
St3gal5O88829 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
St3gal5O88829 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
St3gal5O88829 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
St3gal5O88829 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
St3gal5O88829 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
St3gal5O88829 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
St3gal5O88829 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
St3gal5O88829 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
St3gal5O88829 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
St3gal5O88829 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
St3gal5O88829 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
St3gal5O88829 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
St3gal5O88829 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
St3gal5O88829 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
St3gal5O88829 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
St3gal5O88829 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
St3gal5O88829 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
St3gal5O88829 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
St3gal5O88829 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
St3gal5O88829 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
St3gal5O88829 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
St3gal5O88829 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
St3gal5O88829 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms