Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Srpk1O70551 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srpk1O70551 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Srpk1O70551 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Srpk1O70551 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srpk1O70551 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Srpk1O70551 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Srpk1O70551 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srpk1O70551 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Srpk1O70551 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Srpk1O70551 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Srpk1O70551 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Srpk1O70551 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Srpk1O70551 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Srpk1O70551 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srpk1O70551 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srpk1O70551 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srpk1O70551 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms