Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngr1O55100 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngr1O55100 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngr1O55100 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngr1O55100 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syngr1O55100 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syngr1O55100 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngr1O55100 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngr1O55100 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syngr1O55100 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syngr1O55100 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngr1O55100 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syngr1O55100 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syngr1O55100 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syngr1O55100 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syngr1O55100 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syngr1O55100 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Syngr1O55100 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syngr1O55100 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Syngr1O55100 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syngr1O55100 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syngr1O55100 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms