Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
SncaO55042 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
SncaO55042 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
SncaO55042 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,32■■□□□ 1
SncaO55042 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
SncaO55042 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,31■■□□□ 1
SncaO55042 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,31■■□□□ 1
SncaO55042 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
SncaO55042 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
SncaO55042 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
SncaO55042 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,28■■□□□ 1
SncaO55042 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,27■■□□□ 1
SncaO55042 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
SncaO55042 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
SncaO55042 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
SncaO55042 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
SncaO55042 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
SncaO55042 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
SncaO55042 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
SncaO55042 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
SncaO55042 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
SncaO55042 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
SncaO55042 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
SncaO55042 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
SncaO55042 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
SncaO55042 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
SncaO55042 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
SncaO55042 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
SncaO55042 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
SncaO55042 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
SncaO55042 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
SncaO55042 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
SncaO55042 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
SncaO55042 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
SncaO55042 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
SncaO55042 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
SncaO55042 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
SncaO55042 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
SncaO55042 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
SncaO55042 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
SncaO55042 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,01■□□□□ 0,95
SncaO55042 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
SncaO55042 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
SncaO55042 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
SncaO55042 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
SncaO55042 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
SncaO55042 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
SncaO55042 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
SncaO55042 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
SncaO55042 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
SncaO55042 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
SncaO55042 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
SncaO55042 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
SncaO55042 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
SncaO55042 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,91■□□□□ 0,94
SncaO55042 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
SncaO55042 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
SncaO55042 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
SncaO55042 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
SncaO55042 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
SncaO55042 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
SncaO55042 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,89■□□□□ 0,93
SncaO55042 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
SncaO55042 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
SncaO55042 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
SncaO55042 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,87■□□□□ 0,93
SncaO55042 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
SncaO55042 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
SncaO55042 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,86■□□□□ 0,93
SncaO55042 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
SncaO55042 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
SncaO55042 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
SncaO55042 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
SncaO55042 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,83■□□□□ 0,93
SncaO55042 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
SncaO55042 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
SncaO55042 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
SncaO55042 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,8■□□□□ 0,92
SncaO55042 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
SncaO55042 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
SncaO55042 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
SncaO55042 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,78■□□□□ 0,92
SncaO55042 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
SncaO55042 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
SncaO55042 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
SncaO55042 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
SncaO55042 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
SncaO55042 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
SncaO55042 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
SncaO55042 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
SncaO55042 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
SncaO55042 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
SncaO55042 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20,74■□□□□ 0,91
SncaO55042 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,74■□□□□ 0,91
SncaO55042 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
SncaO55042 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
SncaO55042 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
SncaO55042 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
SncaO55042 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
SncaO55042 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms