Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna4O35343 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kpna4O35343 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna4O35343 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna4O35343 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna4O35343 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna4O35343 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna4O35343 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna4O35343 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna4O35343 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna4O35343 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna4O35343 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna4O35343 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna4O35343 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna4O35343 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna4O35343 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kpna4O35343 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kpna4O35343 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kpna4O35343 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kpna4O35343 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms