Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myh11O08638 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myh11O08638 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myh11O08638 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myh11O08638 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myh11O08638 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myh11O08638 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myh11O08638 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Myh11O08638 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Myh11O08638 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Myh11O08638 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myh11O08638 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myh11O08638 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myh11O08638 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myh11O08638 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myh11O08638 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myh11O08638 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myh11O08638 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Myh11O08638 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Myh11O08638 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Myh11O08638 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Myh11O08638 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Myh11O08638 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Myh11O08638 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Myh11O08638 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myh11O08638 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Myh11O08638 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myh11O08638 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Myh11O08638 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Myh11O08638 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myh11O08638 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Myh11O08638 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myh11O08638 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myh11O08638 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Myh11O08638 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Myh11O08638 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myh11O08638 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myh11O08638 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myh11O08638 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myh11O08638 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myh11O08638 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Myh11O08638 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myh11O08638 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myh11O08638 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myh11O08638 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myh11O08638 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myh11O08638 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myh11O08638 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myh11O08638 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myh11O08638 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myh11O08638 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms