Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC117090L7N257 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC117090L7N257 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC117090L7N257 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC117090L7N257 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC117090L7N257 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BC117090L7N257 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC117090L7N257 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC117090L7N257 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BC117090L7N257 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BC117090L7N257 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC117090L7N257 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BC117090L7N257 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC117090L7N257 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC117090L7N257 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC117090L7N257 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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