Protein–RNA interactions for Protein: E9QMW4

Uncharacterized protein C16orf96 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9QMW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9QMW4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
E9QMW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9QMW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
E9QMW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9QMW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E9QMW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9QMW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9QMW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9QMW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E9QMW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E9QMW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E9QMW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
E9QMW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9QMW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
E9QMW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9QMW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E9QMW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
E9QMW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E9QMW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
E9QMW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E9QMW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E9QMW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
E9QMW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E9QMW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E9QMW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E9QMW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E9QMW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E9QMW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9QMW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9QMW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9QMW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9QMW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9QMW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9QMW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9QMW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9QMW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9QMW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9QMW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E9QMW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E9QMW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E9QMW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9QMW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9QMW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9QMW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9QMW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9QMW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9QMW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
E9QMW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E9QMW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E9QMW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9QMW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9QMW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E9QMW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E9QMW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E9QMW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9QMW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9QMW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E9QMW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E9QMW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E9QMW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9QMW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E9QMW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E9QMW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9QMW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E9QMW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E9QMW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E9QMW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E9QMW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E9QMW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
E9QMW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9QMW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9QMW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9QMW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9QMW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9QMW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9QMW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9QMW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9QMW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9QMW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9QMW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9QMW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9QMW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9QMW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9QMW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9QMW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9QMW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9QMW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9QMW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
E9QMW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9QMW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9QMW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9QMW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9QMW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9QMW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9QMW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E9QMW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9QMW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E9QMW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E9QMW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms