Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8237E9Q257 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8237E9Q257 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8237E9Q257 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8237E9Q257 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8237E9Q257 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8237E9Q257 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8237E9Q257 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8237E9Q257 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8237E9Q257 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8237E9Q257 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8237E9Q257 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm8237E9Q257 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm8237E9Q257 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8237E9Q257 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm8237E9Q257 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm8237E9Q257 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm8237E9Q257 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8237E9Q257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8237E9Q257 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms