Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsph10bE9PYQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsph10bE9PYQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsph10bE9PYQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsph10bE9PYQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsph10bE9PYQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rsph10bE9PYQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rsph10bE9PYQ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph10bE9PYQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsph10bE9PYQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph10bE9PYQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsph10bE9PYQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsph10bE9PYQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph10bE9PYQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsph10bE9PYQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsph10bE9PYQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rsph10bE9PYQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsph10bE9PYQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph10bE9PYQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph10bE9PYQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph10bE9PYQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph10bE9PYQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsph10bE9PYQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rsph10bE9PYQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rsph10bE9PYQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rsph10bE9PYQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rsph10bE9PYQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rsph10bE9PYQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsph10bE9PYQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms