Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Rsph10bE9PYQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Rsph10bE9PYQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Rsph10bE9PYQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Rsph10bE9PYQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Rsph10bE9PYQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rsph10bE9PYQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rsph10bE9PYQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rsph10bE9PYQ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rsph10bE9PYQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rsph10bE9PYQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rsph10bE9PYQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rsph10bE9PYQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rsph10bE9PYQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Rsph10bE9PYQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rsph10bE9PYQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rsph10bE9PYQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Rsph10bE9PYQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rsph10bE9PYQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Rsph10bE9PYQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rsph10bE9PYQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rsph10bE9PYQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rsph10bE9PYQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rsph10bE9PYQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Rsph10bE9PYQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Rsph10bE9PYQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,2
Rsph10bE9PYQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Rsph10bE9PYQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Rsph10bE9PYQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rsph10bE9PYQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rsph10bE9PYQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rsph10bE9PYQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rsph10bE9PYQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rsph10bE9PYQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64,2 ms