Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD9

Slco5a1, Solute carrier organic anion transporter family member, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco5a1E9PVD9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slco5a1E9PVD9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco5a1E9PVD9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slco5a1E9PVD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slco5a1E9PVD9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco5a1E9PVD9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco5a1E9PVD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slco5a1E9PVD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slco5a1E9PVD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco5a1E9PVD9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slco5a1E9PVD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slco5a1E9PVD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco5a1E9PVD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slco5a1E9PVD9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco5a1E9PVD9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco5a1E9PVD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco5a1E9PVD9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco5a1E9PVD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco5a1E9PVD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco5a1E9PVD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco5a1E9PVD9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco5a1E9PVD9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco5a1E9PVD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco5a1E9PVD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco5a1E9PVD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco5a1E9PVD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco5a1E9PVD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms