Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm1141B9EJU1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm1141B9EJU1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm1141B9EJU1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm1141B9EJU1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm1141B9EJU1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm1141B9EJU1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm1141B9EJU1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm1141B9EJU1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm1141B9EJU1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm1141B9EJU1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm1141B9EJU1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm1141B9EJU1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm1141B9EJU1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm1141B9EJU1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm1141B9EJU1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm1141B9EJU1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm1141B9EJU1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm1141B9EJU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm1141B9EJU1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm1141B9EJU1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm1141B9EJU1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm1141B9EJU1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm1141B9EJU1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm1141B9EJU1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm1141B9EJU1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm1141B9EJU1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm1141B9EJU1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm1141B9EJU1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm1141B9EJU1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm1141B9EJU1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm1141B9EJU1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm1141B9EJU1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm1141B9EJU1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms