Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r232A2RTT5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r232A2RTT5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r232A2RTT5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r232A2RTT5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r232A2RTT5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r232A2RTT5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r232A2RTT5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r232A2RTT5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r232A2RTT5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r232A2RTT5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms