Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprfA2A8L5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprfA2A8L5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprfA2A8L5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprfA2A8L5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprfA2A8L5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprfA2A8L5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprfA2A8L5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprfA2A8L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprfA2A8L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprfA2A8L5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprfA2A8L5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprfA2A8L5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PtprfA2A8L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprfA2A8L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprfA2A8L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprfA2A8L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprfA2A8L5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprfA2A8L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprfA2A8L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprfA2A8L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprfA2A8L5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms