Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ld4A2A7W1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300ld4A2A7W1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300ld4A2A7W1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300ld4A2A7W1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300ld4A2A7W1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd300ld4A2A7W1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300ld4A2A7W1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd300ld4A2A7W1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd300ld4A2A7W1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd300ld4A2A7W1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd300ld4A2A7W1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd300ld4A2A7W1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300ld4A2A7W1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300ld4A2A7W1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd300ld4A2A7W1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd300ld4A2A7W1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd300ld4A2A7W1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ld4A2A7W1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms