Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT140Q96RY7 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms