Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms