Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTF1AQ7RTS3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms