Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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USP34Q70CQ2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
USP34Q70CQ2 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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