Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms