Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms