Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms