Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPB2P35606 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
COPB2P35606 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPB2P35606 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPB2P35606 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPB2P35606 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPB2P35606 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms