Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXD10P28358 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXD10P28358 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HOXD10P28358 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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