Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms