Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms