Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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