Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CECR2Q9BXF3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms