Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms