Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD4L4Q8WXT5 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms