Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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