Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASIC1P78348 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms