Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTGS1P23219 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGS1P23219 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms