Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP4AP20648 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms