Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms