Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms