Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHPF2Q9P2E5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms