Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT140Q96RY7 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT140Q96RY7 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms