Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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