Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NBR1Q14596 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NBR1Q14596 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms