Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCNIQ14094 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms