Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SYCNQ0VAF6 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms