Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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