Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms