Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MMP13P45452 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP13P45452 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MMP13P45452 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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