Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBP1P32455 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GBP1P32455 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GBP1P32455 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GBP1P32455 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms