Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2E1P29083 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms